Sangsoo Kim, ​Ph.D. 김상수 金尙洙

NGS Data Analysis

 

2008년 경부터 본격 보급되기 시작한 Next Generation Sequencing 기술은 생명과학과 생명정보학을 혁신적으로 변화시키고 있다. 이제는 Now Generation이 되었을 정도로 보편화된 기술이지만, 엄청난 양의 데이터를 다뤄야하고, 분석 과정이 복잡하기에 전산 기술에 익술하지 않은 생명과학자에게는 큰 애로 사항이 되고 있다.

​

본 강좌에서는, NGS의 기본 개념, 즉, 생거시퀀싱과의 원리적 차이를 고찰하고, 공개된 NGS 데이터세트를 다운로드하여 찬찬히 살펴 본다. 인간 데이터는 너무 방대하여 데스크톱 컴퓨터로 다루기는 적절하지 않기에, 이 강좌에서는 비교적 작아서 다루기 편리하지만, NGS 데이터 분석의 여러 측면을 모두 접할 수 있는 박테리아 데이터 세트를 이용한다.

​

NGS 데이터의 정도관리, 게놈 매핑, 삽입/결실 확인, 변이 발굴 및 해석 등의 전 과정을 이론과 함께 실습을 통하여 익히게 된다. NGS가 가장 많이 쓰이는 분야가 암 연구라고 하겠는데, 체세포변이를 찾는 원리와 샘플 VCF 파일을 이용하여 주석달기 등을 공부하고, RNA-seq 및 ChIP-seq 등은 이론적으로만 다룬다.

​

​동영상 강의 스케줄 (Vimeo, YouTube)